Los Peñones del Santo forma parte del fondeadero de la Bahía de Almuñécar utilizado desde el asentamiento de las primeras colonias fenicias en el siglo IX a.C. hasta la actualidad.

Las referencias documentales señalan la presencia de un posible pecio romano cercano a Las Puntas. Se han recuperado numerosos restos anafóricos destacando las formas Dr 10, datada entre el siglo I a.C. y el I d.C., y Dr 14, adscritas a la segunda mitad del siglo I d.C. hasta el siglo III d.C.. Ambos contenedores estaban destinados al transporte de salazón, coincidiendo su circulación durante el siglo I d.C.. Los centros de producción anafórico más cercanos para las formas de Dr 14 se localizan en Motril y Calahonda.